Em alguns casos, mais frequentemente em mulheres, pielonefrite aguda começa com cistite aguda (palpitações e dor ao urinar, dor na bexiga, hematúria terminal). Outros sintomas da mielonefrita aguda: fraqueza geral, fadiga, mialgia, dor de cabeça, falta de apetite, náuseas, vómitos.