A proteína C ativada cliva os fatores Va e VIIIa, inibindo assim o processo de coagulação. Qualquer uma das várias mutações do fator V causa sua resistência à proteína C ativada, aumentando assim a tendência à trombose. A mutação de fator V mais comum é a mutação de Leyden. As mutações homozigóticas aumentam, em maior medida, o risco de trombose do que as heterocigotas.