O agente causador da peste é uma pequena e imobilizada haste fixa e polimórfica Yersinia pestis da família Enterobacteriaceae do gênero Yersinia. Tem uma cápsula mucosa, não forma esporo. Anaeróbico facultativo. É colorido por corantes anilina bipolares (mais intensamente ao redor das bordas). Isolar ratazanas, matois, gopher, vôo e variedades arenosas de bactérias de peste.