A febre hemorrágica de Crimeia é diferenciada de outras febres hemorrágicas, influenza, leptospirose, meningococcemia. Tifóide, doenças cirúrgicas com a síndrome de "abdome agudo"; e de púrpura trombocitopénica (doença púrpura trombocitopénica) com início subagudo característica, a falta de reacção de temperatura, erupção hemorrágica de pequeno petéquias a grande equimose sobre as superfícies do flexor das extremidades, tronco, nasal frequente e outras hemorragias, anemia hipocrómica, leucocitose, trombocitopenia e ausência de alterações sistema cardiovascular.