As complicações do trato biliar após o transplante hepático se desenvolvem em 10-20% dos casos. Estes incluem restrições, fluxo de bile, fístula e colangite. Pode haver estenoses de anastomose devido a erros técnicos, devido à expiração de inflamação e fibrose biliar e estenose, não anastomose, anastomose formada acima da porta na direcção do fígado causada em alguns casos condutas de isquemia.