O diagnóstico clínico de qualquer forma de infecção por Hib, exceto epiglotite, é aproximado, visto que o Hib é o seu agente causador mais comum. O diagnóstico de infecção por Hib é estabelecido com base no isolamento de uma hemocultura do patógeno e de uma cultura de secreções patológicas (líquido cefalorraquidiano, pus, derrame pleural, escarro, esfregaços nasofaríngeos).